Если программа вываливается по тайм ауту, то один из способов устранения проблемы( считаем, что оптимизация не возможна) является использование ФМ TH_REDISPATCH .

Также можно изменить параметр 'rdisp/max_wprun_time' в транзакции RZ11. Параметр применяется без перезагрузке сервера.